تعیین تنوع ژنتیکی جمعیت ماهیان گورخری Aphanius ginaonis و Aphanius dispar در آبهای داخلی هرمزگان و بوشهر با استفاده از نشانگر مولکولیPCR-RFLP

نوع مقاله: مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 گروه زیست‌شناسی دریا، دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی، دانشگاه علوم و فنون دریایی، خرمشهر

2 گروه بیولوژی دریا، مرکز مطالعات و پژوهش‌های خلیج فارس، دانشگاه خلیج فارس بوشهر

چکیده

در این مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت ماهیان گورخری گنو و معمولی با استفاده از روش PCR-RFLP بررسی گردید. جهت تعیین تنوع ژنتیکی این دو ماهی در حوضه خلیج فارس، تعداد 30 نمونه ماهی گورخری گنو (Aphanius ginaonis) از چشمه آب‌ گرم‌ گنو در استان هرمزگان و 30 نمونه ماهی گورخری معمولی (Aphanius dispar) از چشمه آب گرم میراحمد در استان بوشهر جمع‌‌آوری گردید. جهت هضم آنزیمی محصول PCR به طول 550 جفت‌‌باز در ناحیه D-loopمیتوکندریایی، از 5 آنزیم محدودگرAluI, DpnI, Eco47I, HindIII HinfI استفاده شد. در نتیجه این آنالیزها، 12 هاپلوتیپ متفاوت به دست آمد که 9 هاپلوتیپ مربوط به ماهی گورخری گنو و 3 هاپلوتیپ مربوط به ماهی گورخری معمولی بود. 4 هاپلوتیپ به دست‌‌ آمده در ماهی گورخری گنو جزء هاپلوتیپ‌‌های نادر بودند. در ماهی گورخری معمولی هاپلوتیپ AAAAA بیشترین فراوانی را دارا بود و در ماهی گورخری گنو هاپلوتیپ‌‌های EABAB، EACAB و CABAB بیشترین فراوانی را نشان دادند. میزان تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت نمونه های ماهی A.ginaonis ، 79/0 و در نمونه های ماهی A.dispar ، 3/0 و تنوع نوکلئوتیدی در درون جمعیت نمونه های ماهی A.ginaonis، 19/0 و در نمونه های ماهی A.dispar ، 05/0 محاسبه گردید. محاسبه تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی نشان داد که تنوع در ژنوم میتوکندریایی ماهی گورخری گنو بالاتر از ماهی گورخری معمولی است. بررسی‌های انجام شده بر ژنوتیپ‌‌های حاصله نشان داد که PCR-RFLP تکنیک مناسبی جهت تعیین تنوع ژنتیکی در دو گونه ماهی مذکور می‌‌باشد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


Alkahem, H.F., Ahmed, Z. and Arrasheed, M.A. 1994. Comparative study on the Rates of Respiration of a Native Saudi Arabian fish Aphanius dispar (Ruppell, 1828) and an Introduced Competitor, Gambusia affinis (Baird and Girard, 1853) under Laboratory Conditions; Journal king Saudi University.7 (2): 245-253.

Al-Kahem-Al-Balawi, H.F., Al-Ghanim, K.A., Ahmad, Z., Temraz, T.A., Al-Akel, A.S., Misned, F.Al. and Annazri, H. 2008. A Threatened Fish Species (Aphanius dispar) in Saudi Arabia, A Case Study. Pakistan Journal of Biological Sciences. 11 (19): 2300-2307.

Brown, W.M. 1989. Genetics: a molecular approach. London: Van Nostrand Reinhold (International). GB. 467 p. (QH 442 .B7).

Coad, B.W. 1988. Aphanius vladykovi,a new species of tooth-carp from the Zagros Mountain of Iran (Osteichthyes: Cyprinidontidae). Environmental Biology of Fishes. 23: 115- 125.

Cronin, M.A., Hilis, S., Born, E.W. and Potton, C. 1994. mtDNA variation in Atlantic and Pacific walruses. Genetics. 3. 2001. 72: 1035-1043.

Dunham, J.B. and Minckley, W.L. 1997. Allozymic variation in desert pupfish from natural and artificial habitats: genetic conservation in fluctuating populations. Molecular Phylogenetic and Evolution. 84: 7-15.

Durna, S., Bradkci, F. and Degerli, N. 2010. Genetic diversity of Garra rufa Heckel, 1843 (Teleostei: Cyprinidae) in Anatolia. Biochemical Systematics and Ecology. 30: 83-92.

Esmaeili, H.R., Ebrahimi, M. and Saifali, M. 2008. Karyological analysis of five tooth-carps (Actinopterygii: Cyprinodontidae) from Iran. Micron. 39:95–100.

Esmaeili, H.Z. and Gholami, Z. 2008. Investigation on the surface ultrastructure of scale of Geno tooth-carp, Aphanius ginaonis (Holly, 1929) (Actinopterygii: Cyprinodontidae) using scanning electron microscope. Iranian Journal of Biology. 20(2): 307-314.

Frenkel, V. and Goren, M. 2000. Factors affecting growth of killifish, Aphanius dispar, a potential biological central of mosquitoes. Aquaculture. 184: 255- 265.

 

 

Galil, B.S. 2007. Loos or gain? Invasive aliens and biodiversity in the Mediterranean sea. Marine Pollution Bulletin. 55, 314-322.

Hillis, D. M. and Moritz, C. 1990. Molecular taxonomy. Sinauer Associates Inc Publishers. Sunderland, Massachusetts. U. S. A. 120 p.

Hrbek, T.F., Keivany, Y. and Coad, B.W.  2006. New species of Aphanius (Teleostei, Cyprinodontidae) from Isfahan province of Iran and a reanalysis of other species. Copeia. 2: 244–255.

Khaje, P. 2010. Investigation of genetic polymorphic of Geno tooth-carp, Aphanius ginaonis (Holly, 1929) in mitochondrial D-loop region. Master,s thesis. Hormozgan university.  89 pp.

Nahavandi, R., Rezvani, S., Vosoughi, Gh., Kazemi, B. 2006. Gene 18s rRNA variation of cuttlefish population (Sepia pharaonis) in the Persian Gulf and Oman Sea using PCR-RFLP method. Iranian Scientific Fisheries Journal. 14(2): 157-168.

Reichenbacher, B., Feulner, G.R. and Schulz-Mirbach, T.  2009. Geographic variation in otolith morphology among freshwater populations of Aphanius dispar (Teleostei, Cyprinodontiformes) from the Southeastern Arabian Peninsula. Journal Morphology. 270:469–484.

Taggart, J.B. and Hynes, R.A., 1998. A simplified protocol for routine total DNA isolation from fishes. Journal of fish biology. 42: 628-639.